孤儿瑞佐从小被一个名叫奥祖奴的神秘集团所收养，并被训练成为一位武功极高的刺客。因为自己的好朋友被奥祖奴集团残忍杀害，原本就已经厌倦杀人生涯的瑞佐，就此下决心脱离集团，随后隐藏起来，等待时机为朋友报仇。 欧洲探员米卡在调查一系列政治谋杀案件时，发现案情似乎与一群来自远东的刺客有关。随后她违抗上司的命令，偷偷查找了秘密档案文件，了解了凶案背后的真相。为此奥祖奴集团派出一队杀手，打算杀人灭口。就在紧急关头，瑞佐救下了米卡，两人决定共同对付奥祖奴集团，将其彻底摧毁，就在欧洲的街道上，上演了一场猫鼠游戏…… 吴大师训练了4位擅长幻影旋转术的幻影忍者，他们正在寻找4件威力无比的黄金武器，以维护世界和平。魔王加满都和他的骷髅军团紧随其后，企图夺走武器并统治世界。勇敢的幻影忍者们踏上征途，一路战斗，但最终魔王加满都利用4件黄金武器离开了幻影忍者王国。 在纽约市一条大街的地下管道里住着四只功夫高强的忍者神龟和他们的老师斯普林特，一只来自日本的超级大老鼠，为了保卫城市家园，他们同狡猾的巴克斯特·斯多克曼博士、紫龙帮的坏蛋以及一伙神秘且训练有素的忍者（史 繁华大都会美国纽约，邪恶领袖施莱德率领的大脚帮在城市内为非作歹，甚嚣尘上。安保公司老板埃里克·萨克斯推出最新安保系统，发誓维护城市的和平。第6频道女记者爱普尔·奥尼尔偶然拍到大脚帮被四名神秘侠客挫败的画面，在第二次遭遇非常事件时，她惊讶地发现四名侠客竟然是变异后的巴西龟：拉斐尔、列奥纳多、米可朗基罗、多纳泰罗。忍者神龟的名字勾起了爱普尔儿时的记忆，当年她的父亲与萨克斯正是研究生物变异实验的伙伴。她将这个消息告诉给萨克斯，可是在和忍者神龟及其老师斯普林特会面后，才发觉萨克斯与施莱德是这座城市内的罪恶之源…… 
