进入了明治时代，曾经的“刽子手拔刀斋”绯村剑心（佐藤健 饰）已经习惯了神谷道场的安宁生活。谁知就在这一天，倒幕战争时的旧友——号称维新三杰之一的大久保利通（宫泽和史 饰）将其请去。原来继承了剑心刽子手 为了救神谷薰（武井咲 饰），绯村剑心（佐藤健 饰）纵身跃入大海，昏迷中他飘到某座小岛，最终为传授了他飞天御剑流的师父比古清十郎（福山雅治 饰）所救。深感到自身与志志雄真实（藤原龙也 饰）的巨大差距，为 这次特别篇的舞台，是吉宗治世20多年后的江户城。原创系列中年轻的将军吉宗也面临着六十大寿的继承问题。剧中保留了系列的世界观和魅力，在继承问题上摇摆不定的吉宗和江户城内的人们的模样，以及在城下町发生的阴 
