21世纪第一个50年，人类没有迎来最终的繁荣与和平，反而陷入旷日持久的星际战争中。地外文明辛塔利入侵地球，无数人类的勇士前仆后继，战死沙场。时间来到2079年。为了最终摧毁外星入侵者，人类加紧对新式武器的开发。斯宾赛·奥哈蒙是武器研发部门的工程师，他的研究取得突破，新式武器的诞生指日可待。而就在这关键时刻，斯宾塞的身份遭到质疑。政府怀疑他是辛塔利派来的间谍，其体内更藏有一颗威力强大的炸弹。他虽然不断辩解，但无济于事。眼看命悬一线，斯宾塞伺机逃亡。他一面躲避政府的追捕，一面要想方设法证明自己的清白。在这一 莲见雄一（市原隼人 饰）与母亲、继父、弟弟生活在一个幽静的小城里。他跟同班同学星野修介（忍成修吾 饰）同在剑道部，两人成为好朋友。星野本来是一个品学兼优的学生，却遭到了同学的嫉妒。当暑假时一群同学自冲 升上五年级后，被取消魔女资格的DoReMi等人，还是一直在魔法堂花店工作，并认识了新的朋友桃子。被送入幼稚园的小花魔力越来越大，引发了一系列的麻烦，也让DoReMi等人开启了新的冒险。 从出木杉那里听了鸟人传说的故事的大雄靠自己的力量反复做飞到天上的实验然后撞到了突然出现的人力飞机。撞到的是一个长着翅膀的鸟人古斯基，他们把古斯基藏在鸟箱型露营胶囊里，修理着古斯基坐来的人力飞机的哆啦A梦他们坐着那个飞机飞了起来，天空中突然出现一个巨大的洞把大家都吸了进去！！大洞的另一侧是住着鹳身的接生婆，塘鹅邮递员的鸟托邦，哆啦A梦他们戴着小鸟帽成了鸟人的伙伴。古斯基在候鸟巡逻队的入队测验的伊卡洛斯耐力赛中优胜，但不是用自己的翅膀，而是人力飞机，于是被取消了资格。为了寻找受到冲击而失踪的古斯基哆啦 草帽海贼团的船“黄金梅利号”在悠闲度假大伙眼前被偷走了，后来他们在寻找船的途中遇到一对小偷兄弟，从他们口中打听到小偷是现在统治着发条岛的“扑克牌海贼团”，而小偷兄弟正好也要去偷取岛上著名的“钻石钟”，双方的目标一致，决定联手攻进扑克牌海贼团的大本营，但可怕的头目“大熊王”手中却掌握著攸关整座发条岛生死的巨大发条…… 柯南一行人在露营的回家途中顺道参观一座位于西多摩市境内即将在近期完成的全日本最高双塔摩天大楼。而这摩天大楼的拥有者同时也邀请了小五郎与小兰前来参加开幕典礼，因而与柯南一行人偶然巧遇。一行人在秘书的带领之下参观了这座两栋几乎一模一样的最尖端高科技双塔摩天大楼。但是，此时在这摩天大楼里却出现了多位与此建筑物有着不同关系的人士，不久之后第一个杀人事件发生了。而且，令人不敢相信的是黑衣组织的成员竟然同时也在大楼附近出现…… 柯南一行人在露营的回家途中顺道参观一座位于西多摩市境内即将在近期完成的全日本最高双塔摩天大楼。而这摩天大楼的拥有者同时也邀请了小五郎与小兰前来参加开幕典礼，因而与柯南一行人偶然巧遇。一行人在秘书的带领之下参观了这座两栋几乎一模一样的最尖端高科技双塔摩天大楼。但是，此时在这摩天大楼里却出现了多位与此建筑物有着不同关系的人士，不久之后第一个杀人事件发生了。而且，令人不敢相信的是黑衣组织的成员竟然同时也在大楼附近出现…… 40年前的一片大森林中。一个叫雪成的男孩遇到了被神奇宝贝猎人追捕并受重伤的时拉比，当他们被神奇宝贝猎人追的走投无路的时候，时拉比带着雪成到了40年后，正好小智他们在这森林里，他们救了雪成，雪成告诉了小智他们关于时拉比的事，小智他们救了时拉比，并和他成为了好朋友。与此同时，火箭队的三干部比夏斯也在寻找着并打算捕猎时拉比。比夏斯拥有能将一切神奇宝贝变得凶恶的黑暗球，将时拉比自小智他们的身边夺走。为了拯救被比夏斯捕捉的雪拉比，小智与雪成拼命奋战。可是，温柔的时拉比已经发生了很大的变化…… 激烈的对战中，传说中的 赛斯上校及其同伙因对平民展开报复行动被送到军事法庭审判，他为了避开终生监禁的刑期，而与皮斯卡法官达成认罪协议，但皮斯卡出尔反尔，赛斯相当生气，在逃狱后挟持了皮斯卡所搭乘的客机，打算将皮斯卡携带的间谍资料公诸于世，让皮斯卡身败名裂。军方派出救援队却宣告失败，救援队唯一的生还者麦特跟空服员凯丽携手合作，一起制服了劫机犯，凯丽在机场人员的指导下顺利让飞机安全降落。 
